على الرغم من الفوائد المتعددة لتناول فنجان من الشاي الأخضر يومياً إلا أنه ليس من الآمن تناوله خلال فترة الحمل وخاصة شهور الحمل الأولى لاحتوائه على مادة الكافيين التي قد تؤدي الى أضرار خطيرة كحدوث إجهاض أو انخفاض وزن الطفل عند الولادة.
وذلك لأن الشاي الأخضر والأسمر على حد سواء يقللان من قدرة الجسم على امتصاص حمض الفوليك وهو من المكملات الغذائية الهامة خلال فترة الحمل وخاصة الشهور الأولى منه لأنه يعمل على منع حدوث تشوهات خلقية للجنين.
وفي دراسة أعدت مؤخراً في جامعة ألبرتا شكك العلماء في الفوائد المطلقة لهذه المشروبات الساخنة، حيث أظهرت الاختبارات أن العديد من أنواع الشاي تحتوي على تركيزات خطرة من الرصاص، التي يمكن أن تضر النساء الحوامل، والمرضعات، وأطفالهن، وفقا لصحيفة ناشيونال بوست. حتى الجرعات الصغيرة من الرصاص له تأثير سلبي على نمو الاجنة الامر الذي يؤثر على الجهاز العصبي.بالإضافة إلى ذلك، تحدث الخبراء عن وقت تخمر الشاي. فقد لوحظ أعلى تركيز للرصاص في الشاي في تلك التي تختمر لمدة 15 دقيقة .لذا، يوصي العلماء النساء الحوامل والمرضعات بشرب الشاي المخمر الطازج، على ان لا تتعدى الكمية 1-2 أكواب يوميا .ويحتوي الشاي الأخضر على الكافيين الذي يسبب بعض الآثار الجانبية فقد يزيد من حالات الاضطرابات والقلق ومن خطر النزيف وتفاقم أعراض القولون العصبي.
وللشاي الأخضر أضرار عامة إذا تم الإفراط في تناوله حيث يسبب قرحة في المعدة والاثني عشر وإذا تم غليه كثيراً بحيث تحوّل لونه إلى اللون البني الغامق يسبب اضطراباً في عضلة القلب وإمساكاً وكسلاً بالجهاز الهضمي. أما إذا تم تناوله بعد الأكل مباشرة يسبب عسر الهضم، لذلك يفضل شربه بعد ساعة من تناول الأكل على الأقل.